阴离子型聚丙烯酰胺对煤泥的沉降除了高分子絮凝作用外，还发生离子吸附、架桥及电性中和作用，当阴离子度在30%时，这几种作用叠加，达到絮凝效果良好。因而用于煤泥水处理的聚丙烯酰胺阴离子度控制在30%左右为宜。2种不同性能煤泥水的絮凝效果差别很小，与非离子型聚丙烯酰胺的效果类似，均是对粒度大、灰分低的原生煤泥的絮凝效果好于粒度细、灰分高的浮选尾煤。
由于废水水质变化十分复杂，组成千差万别，电荷性各不相同，处理效果也不尽相同。因此，实际应用中应先了解废水水质，然后在此基础上选择合适的阳离子型聚丙烯酰胺絮凝剂，发挥絮凝剂的电荷中和作用与吸附架桥作用。其处理废水的效果与其相对分子质量、阳离子度、加入量、搅拌时间等因素有关。
阳离子聚丙烯酰胺在酸性或碱性介质中均呈现阳电性，它通常会比阴离子或非离子型聚丙烯酰胺分子量低，其澄洁污水的性能主要是通过电荷中和作用而获得。这类絮凝剂的功能主要是絮凝带负的电荷，具有除浊、脱色功能。在酒精厂、味精厂、制糖厂、肉制品厂、饮料厂、印染厂的等废水处理中用阳离子聚丙烯酰胺要比用阴离子聚丙烯酰胺，非离子聚丙烯酰胺或无机盐效果要高数倍或数十倍，因为这类废水普遍带有阴电荷。
聚丙烯酰胺是一种高分子有机混凝剂，一般用于污水处理，也有少数情况用于给水处理。用无机混凝剂处理投加剂量过大且无法达到理想的处理效果，因此采用高分子有机混凝剂聚丙烯酰胺处理高浊度水。聚丙烯酰胺的分子量有低、中、高和超高之分。
聚丙烯酰胺分子量一般为1.5×106～6×107。在残留聚合物含量为600mg/L时，阳离子聚丙烯酰胺的絮凝效果有很大的波动性，很难精准的得到测定结果。通过对阳离子聚丙烯酰胺絮凝效果的考察，分析表明，在同一温度下，随着加剂量的增加，透光率会逐渐增加，达到适用值，然后降低。而且，由于C聚丙烯酰胺结构的特殊性，它的絮凝效果有很大的波动性，重复性、再现性都很差。
残留聚合物含量对于它的絮凝效果的影响就比较大，在残留聚合物含量为很高时，基本上没有絮凝效果，只有在残留聚合物含量较低时，它才有一定的絮凝效果，但是仍然不好。聚丙烯酰胺的阴离子度影响絮凝效果，煤泥水的透光率随阴离子度增大而提高，在阴离子度为30%时达到顶值，然后又随阴离子度的进一步提高而减小。阴离子型聚丙烯酰胺对煤泥的沉降除了高分子絮凝作用外，还发生离子吸附、架桥及电性中和作用，当阴离子度在30%时，这几种作用叠加，达到絮凝效果良好。
