沼气净化设备系统由贮气袋、过滤器、脱水器、脱硫塔、精滤器、阻火器等组成
目前沼气净化设备的方法有三大类，即化学吸收，物理提取和生物脱除。
1、化学吸收。一种化学吸收机理是采用胺、碱，醇等复合溶液吸收剂，应用酸碱中和反应吸收沼气中的CO2、H2S等酸性物质，同时也能吸收NH3等易溶于水、醇的气体。另一种化学吸收机理是采用干化学物质（如Fe2O3）作为吸收剂吸收杂质气体。化学吸收的吸收剂都能够经过安装的自净系统和再生系统释放出各种杂质和气体得到再生循环运用。
2、物理提取。经过此机理净化沼气的主要是变压吸附法。应用吸附剂在不同压力条件下对不同气体吸附力不同的原理来分离沼气中的不同组份。沼气中的H2O、CO2、H2S等吸附容量较大的强吸附组分在一定压力下被吸附剂吸附停留在床层中，而较小吸附容量的弱吸附组分N2、CH4等从床层出口输出，从而完成了对沼气的净化。
3、生物脱除。在一定的条件下应用微生物生长繁衍需沼气中某些杂质气体作为营养物质，从而完成对沼气的净化。